80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2290 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2290  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2131  protein of unknown function DUF606  46.45 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  41.91 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  39.19 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  39.19 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  39.16 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  39.13 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  32.59 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  31.08 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  28.44 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  28.44 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  28.44 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  40.19 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  33.86 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  31.34 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  28.04 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1792  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3512  hypothetical protein  28.44 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  31.82 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3257  hypothetical protein  28.44 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  28.93 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  28.44 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  28.7 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  27.19 
 
 		 386 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3167  hypothetical protein  28.44 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3230  hypothetical protein  28.44 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000207849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3472  hypothetical protein  28.44 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  28.04 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  29.08 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  29.31 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  34.23 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  33.68 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  30.14 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  28.04 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  30.5 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  28.81 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3164  hypothetical protein  27.52 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  25.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  32.63 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  34.91 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  28.08 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  26.17 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  31.69 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  26.62 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  34.41 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  28.3 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  27.4 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  36.56 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  26.55 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  34.48 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  25.55 
 
 		 297 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  36.05 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  33.96 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  32.89 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  35 
 
 		 318 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  26.32 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  30.84 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  31.31 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  39.19 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  31.68 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  27.74 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  35.42 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  33.64 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  27.66 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  41.67 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  30.16 
 
 		 320 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  36.8 
 
 		 163 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  31.47 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  27.43 
 
 		 318 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  26.09 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  22.12 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  30.33 
 
 		 313 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  27.46 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>