32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2053 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2667  peptidyl-dipeptidase A  57.07 
 
 		 620 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6422  Peptidyl-dipeptidase A  53.35 
 
 		 621 aa  684    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1939  Peptidyl-dipeptidase A  57.12 
 
 		 614 aa  691    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2259  Peptidyl-dipeptidase A  78.82 
 
 		 621 aa  1053    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1854  Peptidyl-dipeptidase A  57.12 
 
 		 614 aa  690    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02324  zinc-dependent metallopeptidase  59.08 
 
 		 606 aa  784    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000183943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2544  peptidyl-dipeptidase A  77.76 
 
 		 612 aa  1047    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0184  peptidyl-dipeptidase A  54.01 
 
 		 609 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2170  peptidyl-dipeptidase A  78.82 
 
 		 621 aa  1052    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.200935  normal  0.311175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2340  peptidyl-dipeptidase A  77.6 
 
 		 612 aa  1040    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2057  peptidyl-dipeptidase A  79.97 
 
 		 611 aa  1057    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000365175  normal  0.118156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1785  peptidyl-dipeptidase A  54 
 
 		 622 aa  681    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2125  peptidyl-dipeptidase A  78.18 
 
 		 621 aa  1047    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1585  zinc metallopeptidase family protein  60.89 
 
 		 619 aa  818    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2053  peptidyl-dipeptidase A  100 
 
 		 634 aa  1317    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.10811  normal  0.434811 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4532  hypothetical protein  78.34 
 
 		 621 aa  1050    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2494  zinc-dependent metallopeptidase  78.55 
 
 		 619 aa  1055    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2024  peptidyl-dipeptidase A  57.47 
 
 		 614 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2117  peptidyl-dipeptidase A  74.52 
 
 		 612 aa  997    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000679972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4468  peptidyl-dipeptidase A  57.09 
 
 		 623 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0456  peptidyl-dipeptidase A  56.89 
 
 		 612 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2051  peptidyl-dipeptidase A  78.39 
 
 		 620 aa  1044    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115163  normal  0.257719 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1924  peptidyl-dipeptidase A  77.92 
 
 		 620 aa  1043    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000467858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1887  peptidyl-dipeptidase A  76.44 
 
 		 613 aa  1021    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1467  peptidyl-dipeptidase A  53.37 
 
 		 617 aa  664    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000834106  normal  0.0509695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2156  peptidase M2, peptidyl-dipeptidase A  78.71 
 
 		 619 aa  1045    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.793528 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1817  peptidyl-dipeptidase A  78.69 
 
 		 618 aa  1044    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0907882  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2246  peptidyl-dipeptidase A  78.34 
 
 		 621 aa  1050    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04473  dipeptidyl carboxypeptidase I  48.53 
 
 		 672 aa  587  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.951227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2996  Peptidyl-dipeptidase A  45.21 
 
 		 654 aa  558  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000459005  normal  0.0414122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  23.52 
 
 		 528 aa  79  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00465  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.85 
 
 		 729 aa  44.3  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0349623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>