38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4275 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  47.65 
 
 		 835 aa  769    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  99.78 
 
 		 472 aa  951    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  98.89 
 
 		 376 aa  744    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  100 
 
 		 826 aa  1709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  41.49 
 
 		 822 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  41.61 
 
 		 830 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  43.94 
 
 		 841 aa  565  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  40.8 
 
 		 823 aa  541  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  40.08 
 
 		 789 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  38.78 
 
 		 830 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  37.44 
 
 		 849 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  37.28 
 
 		 845 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  36.94 
 
 		 846 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  34.93 
 
 		 831 aa  485  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  37.67 
 
 		 825 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  35.51 
 
 		 829 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  35.2 
 
 		 847 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  37.78 
 
 		 814 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  35.08 
 
 		 847 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  33.25 
 
 		 835 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  32.13 
 
 		 850 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  32.46 
 
 		 851 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  32.7 
 
 		 847 aa  355  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  30.43 
 
 		 847 aa  337  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.54 
 
 		 827 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  24.28 
 
 		 712 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  24.06 
 
 		 795 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  23.2 
 
 		 821 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  23.93 
 
 		 790 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  25.42 
 
 		 570 aa  62  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  21.7 
 
 		 872 aa  52.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  25 
 
 		 1324 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  22.22 
 
 		 869 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.13 
 
 		 1253 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00635  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.19 
 
 		 742 aa  45.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 		 1172 aa  45.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0509  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.45 
 
 		 412 aa  44.3  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1065  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.54 
 
 		 442 aa  44.3  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>