49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1418 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2841  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  50.27 
 
 		 754 aa  661    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1418  PfaB family protein  100 
 
 		 757 aa  1552    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1325  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  85.44 
 
 		 769 aa  1304    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1452  PfaB family protein  87.52 
 
 		 749 aa  1289    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1424  PfaB family protein  90.96 
 
 		 725 aa  1290    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2930  PfaB family protein  91.3 
 
 		 760 aa  1355    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2734  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  50.66 
 
 		 756 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2667  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  50.48 
 
 		 768 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1220  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  44.94 
 
 		 697 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3203  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  43.43 
 
 		 765 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1422  PfaB family protein  44.14 
 
 		 756 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2908  PfaB family protein  43.9 
 
 		 777 aa  531  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2628  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  46.29 
 
 		 741 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2666  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  41.77 
 
 		 716 aa  485  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1114  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  32.62 
 
 		 687 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1685  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  29.42 
 
 		 854 aa  196  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3103  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  27.69 
 
 		 900 aa  194  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  27.36 
 
 		 1605 aa  177  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  29.11 
 
 		 1107 aa  176  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  28.75 
 
 		 917 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  25.62 
 
 		 1109 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  27.55 
 
 		 2348 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  28.67 
 
 		 2336 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  28.21 
 
 		 2396 aa  140  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  27.62 
 
 		 2391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  26.17 
 
 		 2368 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  28.76 
 
 		 2276 aa  127  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  23.22 
 
 		 2376 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  24.08 
 
 		 2275 aa  95.9  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  24.74 
 
 		 2882 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  26.09 
 
 		 3073 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  23.82 
 
 		 2314 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  25.71 
 
 		 2619 aa  57.8  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  23.2 
 
 		 1488 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  23.26 
 
 		 2553 aa  52.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  21.79 
 
 		 2710 aa  51.2  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  25.12 
 
 		 2664 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  22.8 
 
 		 2503 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  24.53 
 
 		 2614 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  22.39 
 
 		 1658 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  23.35 
 
 		 2750 aa  47.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  26.79 
 
 		 2443 aa  47.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  23.12 
 
 		 2176 aa  47.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  20.31 
 
 		 1911 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  23.52 
 
 		 2620 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  23.26 
 
 		 3243 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  21.97 
 
 		 1349 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  24.63 
 
 		 2386 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  22.49 
 
 		 1480 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>