17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23540  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  523  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  hitchhiker  0.00287708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01220  hypothetical protein  32.69 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02160  hypothetical protein  37.36 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02170  hypothetical protein  84 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26200  hypothetical protein  47.06 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.987392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04540  sporulation related protein  39.51 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000449317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  35.9 
 
 		 794 aa  49.3  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1070  TM2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.607501 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21970  hypothetical protein  42 
 
 		 400 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000547844  hitchhiker  0.00670198 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.78 
 
 		 1149 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06660  hypothetical protein  40 
 
 		 386 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0823  hypothetical protein  53.85 
 
 		 482 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0292128  normal  0.928575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3904  Sel1  51.72 
 
 		 571 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190521  decreased coverage  0.00495215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  56.52 
 
 		 397 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27130  hypothetical protein  62.5 
 
 		 174 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.823012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1432  hypothetical protein  54.17 
 
 		 529 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.177306  decreased coverage  0.000115076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.76 
 
 		 1134 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>