More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01810  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  78.77 
 
 
505 aa  811    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139734 
 
 
-
 
NC_002950  PG0523  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.45 
 
 
498 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0931485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2665  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.18 
 
 
504 aa  760    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0407  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  80.75 
 
 
506 aa  863    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0111575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
506 aa  1046    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.725577  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0834  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.76 
 
 
507 aa  736    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00885026  hitchhiker  0.000156856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3214  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.18 
 
 
503 aa  778    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.27 
 
 
497 aa  711    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000239611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0394  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.81 
 
 
500 aa  727    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.57 
 
 
503 aa  302  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.31 
 
 
504 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.38 
 
 
488 aa  296  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.97 
 
 
483 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.77 
 
 
485 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  37.2 
 
 
484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.89 
 
 
487 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.64 
 
 
487 aa  280  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.55 
 
 
508 aa  278  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  36.18 
 
 
490 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  36.18 
 
 
490 aa  277  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.08 
 
 
490 aa  277  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.67 
 
 
486 aa  276  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.9 
 
 
504 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.38 
 
 
485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.35 
 
 
498 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.14 
 
 
489 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.83 
 
 
497 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.09 
 
 
489 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.96 
 
 
487 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
492 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.42 
 
 
487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.2 
 
 
494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.07 
 
 
507 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.74 
 
 
489 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.65 
 
 
514 aa  270  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.22 
 
 
486 aa  269  8e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
486 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.22 
 
 
487 aa  268  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.53 
 
 
490 aa  268  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.53 
 
 
490 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.35 
 
 
492 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
487 aa  267  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.31 
 
 
490 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.89 
 
 
488 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.8 
 
 
486 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.88 
 
 
487 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
491 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.94 
 
 
489 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.47 
 
 
490 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.66 
 
 
491 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
486 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  33.47 
 
 
486 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.28 
 
 
483 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.62 
 
 
485 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.11 
 
 
490 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.75 
 
 
486 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3508  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
498 aa  264  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
486 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.72 
 
 
496 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.25 
 
 
487 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.83 
 
 
488 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.55 
 
 
488 aa  263  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.02 
 
 
488 aa  262  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.75 
 
 
486 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.8 
 
 
494 aa  262  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.12 
 
 
496 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.9 
 
 
487 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33 
 
 
490 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.8 
 
 
498 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1302  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.9 
 
 
487 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000015836  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.75 
 
 
486 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1246  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.8 
 
 
491 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.8 
 
 
498 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.54 
 
 
493 aa  260  3e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0409  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.9 
 
 
515 aa  261  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000774513  decreased coverage  0.00000719153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
484 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.63 
 
 
488 aa  260  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.1 
 
 
487 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
486 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.69 
 
 
489 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.63 
 
 
488 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
486 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.27 
 
 
486 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.88 
 
 
487 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1453  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.76 
 
 
486 aa  259  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.136087  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1777  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.76 
 
 
486 aa  259  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.814385  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.63 
 
 
488 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
493 aa  259  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>