More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0834 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0523  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.39 
 
 
498 aa  678    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0931485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2665  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.71 
 
 
504 aa  729    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.26 
 
 
497 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000239611  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0834  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
507 aa  1041    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00885026  hitchhiker  0.000156856 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.76 
 
 
506 aa  741    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.725577  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3214  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.69 
 
 
503 aa  766    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978494  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01810  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.1 
 
 
505 aa  771    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0394  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.74 
 
 
500 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0407  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.29 
 
 
506 aa  804    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0111575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.28 
 
 
503 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.8 
 
 
504 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.57 
 
 
488 aa  291  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.01 
 
 
482 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.01 
 
 
482 aa  290  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  37.6 
 
 
484 aa  289  9e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.24 
 
 
488 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.1 
 
 
488 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.33 
 
 
490 aa  286  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.29 
 
 
488 aa  286  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.27 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.1 
 
 
488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.1 
 
 
488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.7 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.12 
 
 
488 aa  282  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.67 
 
 
488 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.09 
 
 
488 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.1 
 
 
490 aa  280  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.52 
 
 
504 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
485 aa  279  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.9 
 
 
488 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.9 
 
 
488 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.9 
 
 
488 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.9 
 
 
488 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.62 
 
 
487 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.62 
 
 
487 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.62 
 
 
487 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.38 
 
 
483 aa  278  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.46 
 
 
489 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.41 
 
 
487 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.41 
 
 
487 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.41 
 
 
487 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.41 
 
 
487 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.27 
 
 
485 aa  276  7e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.15 
 
 
497 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.2 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.8 
 
 
487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.57 
 
 
490 aa  274  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.01 
 
 
487 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.25 
 
 
507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  36.09 
 
 
490 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.21 
 
 
487 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.14 
 
 
488 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.33 
 
 
486 aa  272  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.01 
 
 
487 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  35.89 
 
 
490 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.32 
 
 
488 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.57 
 
 
484 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.05 
 
 
490 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.25 
 
 
488 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.51 
 
 
485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.59 
 
 
493 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.67 
 
 
493 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.49 
 
 
492 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.51 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.45 
 
 
496 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.85 
 
 
487 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.96 
 
 
494 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.38 
 
 
489 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
493 aa  265  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.54 
 
 
496 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.2 
 
 
485 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38 
 
 
490 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.96 
 
 
489 aa  263  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
486 aa  263  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.58 
 
 
487 aa  263  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.34 
 
 
482 aa  262  8.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.13 
 
 
485 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3124  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.35 
 
 
490 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119862  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.02 
 
 
495 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.98 
 
 
486 aa  261  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  35.22 
 
 
484 aa  260  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.39 
 
 
483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.47 
 
 
487 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0788  IMP dehydrogenase  36.63 
 
 
497 aa  259  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.51 
 
 
487 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34 
 
 
497 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.97 
 
 
492 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.83 
 
 
498 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.61 
 
 
491 aa  257  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.54 
 
 
488 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
493 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04240  IMP dehydrogenase, putative  35.97 
 
 
544 aa  256  6e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0375303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.95 
 
 
497 aa  256  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.33 
 
 
499 aa  256  9e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2704  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.78 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139604  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2876  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.78 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112732  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2745  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.78 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00565207  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.41 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2767  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.78 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268112  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.84 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>