19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2504 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2504  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2422  hypothetical protein  85.52 
 
 		 159 aa  253  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3998  hypothetical protein  85.52 
 
 		 159 aa  253  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00055728  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0086  hypothetical protein  39.18 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.176439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  36.24 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  36.24 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  37.04 
 
 		 158 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4379  ERCC4  32.9 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  34.18 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03490  hypothetical protein  26.49 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5189  ERCC4 domain-containing protein  30.92 
 
 		 325 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  30.08 
 
 		 463 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2880  ERCC4 domain protein  25.36 
 
 		 322 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3806  ERCC4 domain-containing protein  24.24 
 
 		 330 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  27.21 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  27.21 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  28.12 
 
 		 808 aa  42  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  30.43 
 
 		 776 aa  41.2  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  32.86 
 
 		 833 aa  41.2  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>