17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0594 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1679  FmdB family regulatory protein  57.33 
 
 		 75 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000331014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  42.11 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  46.34 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  45.24 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  46.51 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  45.24 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  45.24 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  38.98 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  46.67 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  43.18 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  45 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  46.34 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  35.82 
 
 		 76 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>