25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2545 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  70 
 
 		 150 aa  201  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  66.2 
 
 		 165 aa  197  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  57.14 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  53.15 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  51.08 
 
 		 144 aa  136  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  51.08 
 
 		 144 aa  136  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  55.64 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  55.71 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  55.71 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2170  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.93 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  42.45 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  40.88 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  39.44 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  45.9 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0118  hypothetical protein  40.28 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000449189  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  25.87 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  25.87 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0418  hypothetical protein  35.34 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.63884  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  26.02 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0705  putative signal peptide protein  28.47 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4088  putative signal peptide protein  28 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3613  putative signal peptide protein  28 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  24.16 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0942  hypothetical protein  25.51 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00804461  normal  0.623642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>