18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0118 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0118  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000449189  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  48.18 
 
 		 138 aa  141  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2170  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.13 
 
 		 138 aa  112  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  48.36 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  44.63 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  40.54 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  37.41 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  41.38 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  40.28 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  42.98 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  45.45 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0418  hypothetical protein  33.9 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.63884  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  41.38 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  38.3 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  38.3 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  40.85 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  39.44 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1162  hypothetical protein  36.5 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000143344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>