19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0421 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  299  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0418  hypothetical protein  50.34 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.63884  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  51.59 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0118  hypothetical protein  44.63 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000449189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  44.44 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  43.36 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  49.04 
 
 		 165 aa  95.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  45.53 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  39.44 
 
 		 149 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  36.23 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  39.42 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  42.96 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  35.42 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  35.42 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2170  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.91 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  36.3 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  35.62 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  30.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  30.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>