26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4777 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  67.36 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  65.54 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  65.54 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  60 
 
 		 144 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  59.72 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  51.03 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  54.41 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  51.08 
 
 		 149 aa  136  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  42.86 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2170  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.69 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  37.41 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  32.87 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  32.87 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  41.96 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  35.42 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0118  hypothetical protein  38.3 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000449189  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  31.91 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0705  putative signal peptide protein  30.34 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0418  hypothetical protein  35.05 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.63884  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0942  hypothetical protein  26.57 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00804461  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  26.57 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4088  putative signal peptide protein  26.89 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3613  putative signal peptide protein  26.89 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1162  hypothetical protein  27.14 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000143344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>