21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3699 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  100 
 
 		 144 aa  294  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  100 
 
 		 144 aa  294  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  63.89 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0942  hypothetical protein  41.13 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00804461  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  42.55 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  37.24 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4088  putative signal peptide protein  37.06 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  33.81 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0705  putative signal peptide protein  38.73 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3613  putative signal peptide protein  36.36 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  31.25 
 
 		 165 aa  84.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  32.87 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  32.87 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  35.86 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  34.03 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  33.8 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  31.25 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  25.87 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  27.08 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  28.8 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>