20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3049 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  100 
 
 		 140 aa  283  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0942  hypothetical protein  89.29 
 
 		 140 aa  255  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00804461  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3613  putative signal peptide protein  49.28 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4088  putative signal peptide protein  48.23 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0705  putative signal peptide protein  43.97 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  42.55 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  42.55 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  45 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  26.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  26.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  26.57 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  29.25 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  28.57 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  28.57 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  29.92 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  25 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  24.16 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  24.24 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  28.57 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  29.17 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>