19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0942 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0942  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00804461  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  89.29 
 
 		 140 aa  255  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0705  putative signal peptide protein  46.1 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3613  putative signal peptide protein  47.48 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4088  putative signal peptide protein  46.43 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  41.13 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  41.13 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  40.83 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  26.76 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  26.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  26.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  29.66 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  30.34 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  29.73 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  27.78 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  24 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  23.47 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  28.83 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  25.51 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>