20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4088 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4088  putative signal peptide protein  100 
 
 		 141 aa  288  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3613  putative signal peptide protein  98.58 
 
 		 141 aa  284  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  48.23 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0942  hypothetical protein  46.43 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00804461  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0705  putative signal peptide protein  43.97 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  42.54 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  37.06 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  37.06 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  29.66 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  30.69 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  28.47 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  27.78 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  31.86 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  27.1 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  26.89 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  26.89 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  28.71 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  28 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  25.51 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  22.45 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>