25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1774 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  68.97 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  66.2 
 
 		 149 aa  197  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  53.47 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  51.03 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  51.03 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  51.7 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  50.34 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  50 
 
 		 144 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  50 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  45.45 
 
 		 138 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  45.24 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2170  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.34 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  46.46 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0118  hypothetical protein  40.54 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000449189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  49.04 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  31.25 
 
 		 144 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  31.25 
 
 		 144 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0418  hypothetical protein  38.94 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.63884  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0705  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4088  putative signal peptide protein  27.1 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3613  putative signal peptide protein  26 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  24.24 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0942  hypothetical protein  23.47 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00804461  normal  0.623642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>