21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3907 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3907  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0421  hypothetical protein  49.26 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244801  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0118  hypothetical protein  46.38 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000449189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1774  excinuclease ATPase subunit  42.95 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0706  putative excinuclease, ATPase subunit  43.54 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3872  excinuclease ATPase subunit  42.18 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.306665 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1161  excinuclease ATPase subunit  42.36 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000979221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2545  excinuclease ATPase subunit  44.6 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1485  excinuclease ATPase-like protein  42.76 
 
 		 154 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0418  hypothetical protein  43.88 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.63884  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4777  putative excinuclease, ATPase subunit  40.41 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3700  putative excinuclease, ATPase subunit  40.41 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.351228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0943  putative excinuclease, ATPase subunit  43.54 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370143  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2170  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.81 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3048  putative excinuclease, ATPase subunit  42.54 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0407127  normal  0.286707 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4089  excinuclease ATPase subunit  40.16 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3614  excinuclease ATPase subunit  40.16 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4776  conserved hypothetical signal peptide protein  30.61 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3699  putative signal peptide protein  30.61 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356109 
 
 
-
 
NC_003296  RS00762  putative signal peptide protein  23 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.44153  normal  0.410048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3049  conserved hypothetical signal peptide protein  29.17 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0304296  normal  0.277208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>