More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1205 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 264 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  81.06 
 
 		 263 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  81.06 
 
 		 263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.06 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.06 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.06 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.06 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.3 
 
 		 263 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.3 
 
 		 263 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.3 
 
 		 263 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  79.55 
 
 		 263 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.27 
 
 		 263 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  78.71 
 
 		 263 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.69 
 
 		 263 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.62 
 
 		 263 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.48 
 
 		 263 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  57.71 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  57.03 
 
 		 262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  57.71 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  57.71 
 
 		 259 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  57.71 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  57.31 
 
 		 255 aa  295  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.71 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.13 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.75 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.97 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.97 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.98 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.61 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.41 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.94 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  49.41 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  49.03 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.22 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.41 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  49.03 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  48.45 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.45 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.24 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  49.81 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1182  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.25 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  39.3 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.8 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.9 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.69 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1574  ParA family protein  39.52 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0302854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.11 
 
 		 299 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.11 
 
 		 303 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.33 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.94 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  36.95 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  38.11 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.02 
 
 		 337 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  35.16 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  35.32 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.14 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  35.6 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  33.21 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  33.21 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.55 
 
 		 298 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.75 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  34.23 
 
 		 290 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.91 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.23 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.96 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.74 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.74 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.71 
 
 		 329 aa  148  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  36.02 
 
 		 314 aa  148  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.47 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  36.99 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.26 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.6 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  34.24 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.95 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.4 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.99 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.48 
 
 		 367 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  34.96 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  34.96 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  34.96 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.14 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  35.37 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.33 
 
 		 328 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.29 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  32.53 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.25 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.59 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.43 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  32.57 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  34.11 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.68 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>