39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1585 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1585  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
273 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1856  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  99.27 
 
 
273 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1689  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  98.9 
 
 
273 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1653  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  99.27 
 
 
273 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  98.9 
 
 
273 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1914  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  78.39 
 
 
273 aa  457  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  77.21 
 
 
273 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  76.47 
 
 
273 aa  438  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1672  S1A family peptidase  77.57 
 
 
273 aa  421  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2032  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  77.57 
 
 
273 aa  421  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2045  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  77.57 
 
 
273 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2308  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  77.21 
 
 
273 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1601  S1A family peptidase  77.21 
 
 
273 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01557  hypothetical protein  77.21 
 
 
273 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01567  predicted peptidase  77.21 
 
 
273 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  60.52 
 
 
284 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2584  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.17 
 
 
284 aa  318  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2285  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.74 
 
 
273 aa  315  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.17 
 
 
272 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  62.5 
 
 
278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  62.5 
 
 
278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  61.57 
 
 
278 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.21 
 
 
275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0231238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
407 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.63 
 
 
392 aa  85.5  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.02 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.17 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.05 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6589  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.22 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.33 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3870  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.89 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381298  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.38 
 
 
284 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4892  trypsin domain-containing protein  26.43 
 
 
511 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 
235 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1017  hypothetical protein  24.26 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2677  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.76 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  23.89 
 
 
677 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.94 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  25.37 
 
 
438 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>