19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0112 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0112  typeIV prepilin  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3729  type IV pilus biogenesis protein  55.03 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59320  type IV B pilus protein  34.23 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00129697  hitchhiker  0.00000000000539359 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0019  type IV prepilin domain-containing protein PilS  33.51 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4476  type IV B pilus protein  32.89 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1512  prepilin  32.34 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3700  hypothetical protein  30.54 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1760  PilS domain protein  28.12 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2252  putative type IV pilus protein  27.43 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5914  PilS domain-containing protein  28.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353424  hitchhiker  0.00844308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5875  putative type IV pilus biogenesis protein  35.59 
 
 		 164 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0663  putative type IV pilus biogenesis protein  30.07 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.655002  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1984  putative type IV pilus biogenesis protein  30.07 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2168  putative type IV pilus protein  30.07 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00445151  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1605  putative type IV pilus biogenesis protein  30.07 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0158393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0651  putative major pilin subunit  30.07 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0065  putative type IV secretion system protein PilS2  26.35 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2072  putative type IV pilin protein  30.72 
 
 		 185 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00908282  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2312  putative type IV pilin protein  31.06 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  hitchhiker  0.0000000000000870948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>