22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2806 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2806  endodeoxyribonuclease  100 
 
 
189 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1250  exonuclease family protein  48.07 
 
 
255 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1416  exonuclease family protein  47.51 
 
 
823 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1152  exonuclease family protein  47.51 
 
 
813 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000192952  hitchhiker  2.23987e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3177  exonuclease family protein  47.51 
 
 
814 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000796892  hitchhiker  0.00000000000000114787 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2054  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.51 
 
 
825 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0160649  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1427  exonuclease family protein  47.51 
 
 
823 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000107129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1745  exonuclease family protein  47.51 
 
 
823 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113116  decreased coverage  0.0000795102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1784  exonuclease family protein  46.96 
 
 
825 aa  167  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.982095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2287  exonuclease family protein  46.96 
 
 
460 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118532  hitchhiker  0.00000000000465845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2267  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  49.45 
 
 
834 aa  164  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156112  unclonable  0.00000492559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2299  endodeoxyribonuclease  46.81 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0895049  hitchhiker  6.23741e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2815  exonuclease family protein  45.86 
 
 
823 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00747401  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1139  exonuclease family protein  45.86 
 
 
823 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.53396 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2635  hypothetical protein  39.27 
 
 
192 aa  134  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0288656  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2743  endodeoxyribonuclease  40.34 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628227  hitchhiker  0.000774224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00846  Endodeoxyribonuclease  39.56 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.343412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1822  exonuclease family protein  47.11 
 
 
771 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267479  hitchhiker  0.0000000000000385953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3408  endodeoxyribonuclease  39.29 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363386  decreased coverage  0.000737222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1505  exodeoxyribonuclease VIII  48.08 
 
 
114 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313387  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1007  exodeoxyribonuclease VIII  47.87 
 
 
101 aa  95.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257845  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0669  exonuclease  33.53 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>