14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1120 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  36.04 
 
 		 526 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  39.13 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  39.21 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  37.89 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  37.33 
 
 		 277 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  37.31 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  38.14 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  36.5 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  34.72 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  36.22 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  36.22 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  33.91 
 
 		 546 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  29.94 
 
 		 545 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>