80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0541 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 
218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  68.35 
 
 
218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  67.89 
 
 
218 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  67.89 
 
 
218 aa  317  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  67.89 
 
 
218 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  67.43 
 
 
218 aa  315  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  67.43 
 
 
218 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  66.97 
 
 
218 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  65.6 
 
 
218 aa  298  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  67.43 
 
 
218 aa  298  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  62.39 
 
 
219 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  58.11 
 
 
223 aa  278  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  59.63 
 
 
218 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  59.17 
 
 
219 aa  275  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  56.89 
 
 
226 aa  270  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  56.88 
 
 
218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  42.66 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  42.66 
 
 
219 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  43.06 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  42.86 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  42.86 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  38.99 
 
 
220 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  42.2 
 
 
218 aa  178  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 
216 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  41.94 
 
 
218 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  40.83 
 
 
222 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  39.63 
 
 
218 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  42.59 
 
 
220 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  41.2 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  41.86 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  41.87 
 
 
219 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  41.4 
 
 
216 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  40.54 
 
 
211 aa  154  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  44.21 
 
 
218 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  37.24 
 
 
212 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  36.11 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3438  thiopurine S-methyltransferase  35.81 
 
 
213 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  40.09 
 
 
213 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  35.98 
 
 
221 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  37.23 
 
 
230 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  35.51 
 
 
221 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2726  thiopurine S-methyltransferase  40.45 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  41.81 
 
 
218 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  38.58 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02272  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.5 
 
 
217 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1524  thiopurine S-methyltransferase  31.72 
 
 
219 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  36.15 
 
 
230 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2473  Thiopurine S-methyltransferase  32.73 
 
 
217 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.465624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6497  Thiopurine S-methyltransferase  32.88 
 
 
228 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0320896  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2144  Thiopurine S-methyltransferase  36.77 
 
 
214 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00106923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  41.5 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  35.65 
 
 
215 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3057  thiopurine S-methyltransferase  29.86 
 
 
216 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  26.88 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  28.09 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  25.49 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  26.57 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.37 
 
 
261 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.37 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.37 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.37 
 
 
261 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  26.87 
 
 
264 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.87 
 
 
267 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  26.09 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  26.87 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  23.88 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  26.34 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  27.66 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  27.03 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  24.87 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  23.08 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  22.56 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  24.18 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  24.73 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  24.18 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  24.18 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  24.32 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  24.47 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  25.67 
 
 
201 aa  45.1  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  27.11 
 
 
283 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>