38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2285 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  100 
 
 
321 aa  650    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  35.96 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  30.84 
 
 
373 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  28.34 
 
 
367 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  31.25 
 
 
523 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  28.95 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  25.84 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  29.41 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  29.5 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  27.41 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  26.64 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  27.41 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  26.69 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  31.36 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  27.23 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  25.52 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  22.42 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  27.08 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  25.65 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  29.59 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  22.38 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  22.92 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  22.38 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  25.77 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  29.82 
 
 
345 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  22.03 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  28.9 
 
 
345 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  24.67 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  24.49 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  24.67 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  28.57 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  24.67 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  28.57 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  23.81 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  26.34 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  25.3 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>