26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1700 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  100 
 
 
75 aa  155  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  48 
 
 
74 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  46.67 
 
 
74 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  46.67 
 
 
74 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  48 
 
 
74 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  45.33 
 
 
74 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  45.33 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  44 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  41.33 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  41.33 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  42.67 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  38.67 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  39.73 
 
 
73 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0649  MoaD family protein  37.8 
 
 
229 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.321088  hitchhiker  0.00441005 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  32.88 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2001  MoaD family protein  37.04 
 
 
228 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4187  MoaD family protein  32.1 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4226  MoaD family protein  32.1 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139211  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  32.5 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  31.25 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  35.06 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  32 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.06 
 
 
77 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  37.5 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2136  molybdopterin synthase subunit MoaE / molybdopterin synthase subunit MoaD  53.33 
 
 
248 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  32.47 
 
 
74 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>