29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3066 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  100 
 
 		 128 aa  267  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  78.91 
 
 		 128 aa  218  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  77.34 
 
 		 128 aa  216  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  42.52 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  38.58 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  36 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  37.6 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  30.71 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  42.65 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  34.41 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  27.88 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.73 
 
 		 244 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  27.59 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  33.66 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  28 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  28.28 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  24.27 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  24.51 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  29.9 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  27.45 
 
 		 127 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  27.45 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2634  hypothetical protein  34.72 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2590  hypothetical protein  34.72 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538528  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  27.45 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  26.8 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>