19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2773 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  621  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1065  hypothetical protein  63.14 
 
 		 304 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253962  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  35.23 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  35.74 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  35.74 
 
 		 290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  35.84 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  31.96 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  31.38 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1838  hypothetical protein  29.92 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00402348  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1815  hypothetical protein  34.39 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  33.99 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  28.68 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.96 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  34.48 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  27.75 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  24.39 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>