21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2482 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2482  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  361  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2884  hypothetical protein  28.07 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0980  hypothetical protein  30.06 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  0.0628695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1076  hypothetical protein  30.64 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1137  hypothetical protein  28.74 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  27.53 
 
 		 557 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  29.34 
 
 		 553 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  33.58 
 
 		 574 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04871  hypothetical protein  25.88 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  28.32 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3456  hypothetical protein  23.7 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  27.22 
 
 		 527 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1215  hypothetical protein  27.34 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.932644  normal  0.206964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  27.53 
 
 		 554 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3157  hypothetical protein  23.53 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1814  hypothetical protein  25.25 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.075678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1679  hypothetical protein  25.25 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  23.67 
 
 		 550 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  29.48 
 
 		 577 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1886  hypothetical protein  24.37 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.002494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1678  hypothetical protein  24.62 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>