48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2930 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2841  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  51.86 
 
 		 754 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1418  PfaB family protein  91.3 
 
 		 757 aa  1349    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1325  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  88.28 
 
 		 769 aa  1349    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1424  PfaB family protein  95.61 
 
 		 725 aa  1363    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1452  PfaB family protein  90.62 
 
 		 749 aa  1340    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2930  PfaB family protein  100 
 
 		 760 aa  1553    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2734  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  51.74 
 
 		 756 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2667  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  50.26 
 
 		 768 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1220  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  45.47 
 
 		 697 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3203  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  43.91 
 
 		 765 aa  537  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1422  PfaB family protein  44.08 
 
 		 756 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2628  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  46.82 
 
 		 741 aa  524  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2908  PfaB family protein  43.86 
 
 		 777 aa  521  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2666  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  41.96 
 
 		 716 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1114  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  33.82 
 
 		 687 aa  266  8e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1685  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  29.77 
 
 		 854 aa  197  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3103  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  28.66 
 
 		 900 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  28.75 
 
 		 1107 aa  177  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  26.49 
 
 		 1605 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  29.59 
 
 		 917 aa  161  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  26.23 
 
 		 1109 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  28.04 
 
 		 2348 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  27.92 
 
 		 2391 aa  142  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  28.23 
 
 		 2396 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.3 
 
 		 2336 aa  137  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  26.76 
 
 		 2368 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  29.02 
 
 		 2276 aa  125  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  24.71 
 
 		 2376 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  25.68 
 
 		 2275 aa  97.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  26.18 
 
 		 2882 aa  89  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  26.73 
 
 		 3073 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  24.53 
 
 		 2314 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  25 
 
 		 2619 aa  58.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  21.64 
 
 		 2710 aa  54.3  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  25.46 
 
 		 2249 aa  52.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  24.62 
 
 		 2553 aa  52  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  23.1 
 
 		 2503 aa  51.6  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  23.6 
 
 		 3008 aa  51.6  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  25.08 
 
 		 2614 aa  51.2  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  25.17 
 
 		 2664 aa  50.8  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  28.06 
 
 		 2443 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  22.09 
 
 		 1658 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  22.86 
 
 		 1488 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  23.39 
 
 		 2477 aa  47.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  23.55 
 
 		 2719 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  24.26 
 
 		 2620 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  20.57 
 
 		 1911 aa  45.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  20.23 
 
 		 2754 aa  43.9  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>