17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0391 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1176    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  24.05 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  37.95 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  43.26 
 
 
509 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  24.25 
 
 
530 aa  79.7  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  23.42 
 
 
588 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  27.95 
 
 
601 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  32.08 
 
 
540 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  23 
 
 
630 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  25.98 
 
 
556 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  23.84 
 
 
461 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  24.79 
 
 
533 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  26.79 
 
 
712 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  29.61 
 
 
606 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  26.19 
 
 
567 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  25.78 
 
 
976 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  26 
 
 
532 aa  44.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>