More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1299 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 435 aa  865    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  60.95 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  51.22 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  47.54 
 
 		 423 aa  325  8.000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  44.69 
 
 		 422 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  47 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  43.19 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  45.58 
 
 		 432 aa  286  5.999999999999999e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  45.63 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  40.97 
 
 		 447 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  42.28 
 
 		 442 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  44.08 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  41.72 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  42.12 
 
 		 430 aa  269  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  40.72 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  44.93 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  41.27 
 
 		 442 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  40.82 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  40.36 
 
 		 442 aa  263  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  45.18 
 
 		 422 aa  262  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  44.08 
 
 		 424 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  40.13 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  40.88 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  42 
 
 		 448 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  41.82 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  41.89 
 
 		 438 aa  253  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  42.5 
 
 		 437 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  40.38 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  44.16 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  41.08 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  42.96 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  40.27 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  40 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  39.53 
 
 		 441 aa  240  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  39.53 
 
 		 441 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  39.47 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  39.53 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  39.07 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  35.56 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  39.14 
 
 		 442 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  35.65 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  34.9 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  38.46 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  34.92 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  35.32 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.66 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  34.11 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  36.65 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.83 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.32 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.1 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  32.88 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  36.51 
 
 		 422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  31.18 
 
 		 438 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  40 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  31.92 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  32.56 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  38.66 
 
 		 408 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  31.75 
 
 		 431 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.33 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.36 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.36 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  33.98 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  30.23 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  29.29 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  31.28 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  29.45 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  39.38 
 
 		 437 aa  163  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  29.68 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.55 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.33 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.08 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2698  FolC bifunctional protein  38.19 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.713349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  33.65 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  30.84 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  31.41 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  31.75 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  33 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  31.25 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  33.56 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  31.75 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.19 
 
 		 433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.36 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  31.78 
 
 		 433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.72 
 
 		 424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  29.35 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  29.79 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.72 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  29.72 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  29.72 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  29.72 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  31.46 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  31.19 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  31.49 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>