More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1277 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  100 
 
 		 686 aa  1357    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  45.91 
 
 		 671 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  46.32 
 
 		 669 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  46.66 
 
 		 667 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  48.15 
 
 		 688 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  45.39 
 
 		 675 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  47.65 
 
 		 683 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  43.25 
 
 		 681 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  47.06 
 
 		 683 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  47.69 
 
 		 678 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  46.98 
 
 		 682 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  46.99 
 
 		 699 aa  555  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  45.48 
 
 		 670 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  48.2 
 
 		 678 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  41.74 
 
 		 688 aa  549  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  42.62 
 
 		 678 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  42.62 
 
 		 678 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  46.81 
 
 		 696 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  43.71 
 
 		 680 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  44.39 
 
 		 676 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  47.49 
 
 		 655 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  45.31 
 
 		 671 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  45.04 
 
 		 642 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  43.65 
 
 		 660 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  42.55 
 
 		 662 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  42.62 
 
 		 661 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  38.68 
 
 		 653 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  38.24 
 
 		 653 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  35.89 
 
 		 692 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  37.69 
 
 		 690 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  34.06 
 
 		 701 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  34.71 
 
 		 691 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  33.77 
 
 		 701 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  33.09 
 
 		 694 aa  362  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  32.06 
 
 		 695 aa  361  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  35.54 
 
 		 686 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.22 
 
 		 692 aa  357  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  34.32 
 
 		 691 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  33.38 
 
 		 692 aa  354  4e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  30.44 
 
 		 696 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  35.78 
 
 		 688 aa  353  7e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  30.59 
 
 		 696 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  33.53 
 
 		 694 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  31.89 
 
 		 695 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.64 
 
 		 697 aa  351  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  33.58 
 
 		 694 aa  349  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  34.65 
 
 		 680 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.63 
 
 		 682 aa  348  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.18 
 
 		 682 aa  348  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  32.98 
 
 		 679 aa  347  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  32.46 
 
 		 697 aa  347  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  32.32 
 
 		 697 aa  346  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  32.99 
 
 		 670 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  32.02 
 
 		 696 aa  343  4e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  32.11 
 
 		 695 aa  343  5e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  32.69 
 
 		 673 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  32.9 
 
 		 689 aa  343  7e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  31.65 
 
 		 699 aa  343  7e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  32.79 
 
 		 673 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  31.65 
 
 		 699 aa  342  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  33.19 
 
 		 703 aa  340  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  33.62 
 
 		 696 aa  339  9e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  32.99 
 
 		 688 aa  339  9e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  33.23 
 
 		 686 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  31.34 
 
 		 692 aa  338  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  31.18 
 
 		 685 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  33.53 
 
 		 695 aa  337  5e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  33.28 
 
 		 690 aa  336  7e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.59 
 
 		 691 aa  336  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  32.6 
 
 		 692 aa  335  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  31.42 
 
 		 692 aa  334  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  33.33 
 
 		 696 aa  333  5e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  34.05 
 
 		 701 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  34.83 
 
 		 687 aa  333  9e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  31.09 
 
 		 688 aa  332  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  31.96 
 
 		 696 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  34.32 
 
 		 688 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  33.14 
 
 		 690 aa  331  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  33.73 
 
 		 683 aa  331  3e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  31.79 
 
 		 697 aa  331  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  32.68 
 
 		 683 aa  330  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  33.28 
 
 		 656 aa  330  7e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  30.99 
 
 		 692 aa  330  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  30.99 
 
 		 692 aa  330  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  31.2 
 
 		 689 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  32.74 
 
 		 692 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  31.32 
 
 		 692 aa  329  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  32.66 
 
 		 700 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  32.76 
 
 		 698 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  32.74 
 
 		 689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  30.84 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  30.69 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  34.23 
 
 		 685 aa  328  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  32.5 
 
 		 690 aa  328  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03950  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33.24 
 
 		 698 aa  328  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  31.47 
 
 		 691 aa  327  5e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  32.32 
 
 		 698 aa  327  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  31.42 
 
 		 704 aa  326  8.000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  30.56 
 
 		 692 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  30.99 
 
 		 692 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>