20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4138 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4138  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.276184  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3756  hypothetical protein  83.1 
 
 		 212 aa  333  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.919622  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5190  protein of unknown function DUF541  45.21 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3856  protein of unknown function DUF541  42.08 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  26.11 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  23.21 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  24.85 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  22.62 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  28.65 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  26.82 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  26.92 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  26.92 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  26.92 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0492  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6970  protein of unknown function DUF541  30.95 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  25.24 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  21.86 
 
 		 238 aa  42  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  24.86 
 
 		 246 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  26.99 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>