More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2130 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2130  anthranilate synthase component II  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2451  anthranilate synthase component II  81.05 
 
 
240 aa  318  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1589  anthranilate synthase component II  80.1 
 
 
204 aa  317  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1685  anthranilate synthase component II  76.53 
 
 
201 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2913  anthranilate synthase component II  76.92 
 
 
201 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970253  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1428  anthranilate synthase component II  79.58 
 
 
211 aa  310  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2802  anthranilate synthase component II  78.53 
 
 
200 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1663  anthranilate synthase component II  78.53 
 
 
200 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0146464  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2723  anthranilate synthase component II  78.53 
 
 
200 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2702  anthranilate synthase component II  78.53 
 
 
207 aa  304  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2404  anthranilate synthase component II  78.01 
 
 
200 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2252  anthranilate synthase component II  80.56 
 
 
202 aa  300  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1519  anthranilate synthase component II  79.58 
 
 
202 aa  286  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0790647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1461  anthranilate synthase component II  79.58 
 
 
202 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1527  anthranilate synthase component II  79.58 
 
 
202 aa  284  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452213  normal  0.0147223 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3020  anthranilate synthase component II  79.06 
 
 
202 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3523  glutamine amido-transferase  58.88 
 
 
209 aa  245  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2830  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.12 
 
 
226 aa  234  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  59.68 
 
 
531 aa  227  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1933  anthranilate synthase component II  58.29 
 
 
192 aa  225  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0795  anthranilate synthase component II  56.15 
 
 
203 aa  224  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2173  anthranilate synthase component II  58.29 
 
 
192 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  221  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  221  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  221  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  221  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  58.06 
 
 
531 aa  221  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  221  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  221  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  221  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  221  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1153  anthranilate synthase component II  56.99 
 
 
202 aa  220  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02759  anthranilate synthase component II  53.48 
 
 
202 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
531 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1059  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.79 
 
 
200 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003087  anthranilate synthase amidotransferase component  53.48 
 
 
202 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2668  anthranilate synthase component II  56.15 
 
 
193 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02289  glutamine amido-transferase  56.63 
 
 
210 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2305  anthranilate synthase component II  57.22 
 
 
192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2006  anthranilate synthase component II  57.22 
 
 
192 aa  215  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2043  anthranilate synthase component II  55.08 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1933  anthranilate synthase component II  55.08 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.490866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  49.2 
 
 
204 aa  174  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  51.06 
 
 
195 aa  174  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  48.4 
 
 
189 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  50 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4187  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  45.08 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.73 
 
 
193 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083636 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.47 
 
 
190 aa  171  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  49.47 
 
 
190 aa  171  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.96 
 
 
197 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51350  anthranilate synthase component II  48 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250393 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.65 
 
 
193 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4053  anthranilate synthase, component II  47.26 
 
 
204 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3652  anthranilate synthase component II  48.69 
 
 
194 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4169  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.77 
 
 
204 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  48.15 
 
 
190 aa  168  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.77 
 
 
204 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2321  anthranilate synthase, component II  47.18 
 
 
195 aa  168  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.45 
 
 
192 aa  168  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  47.87 
 
 
190 aa  167  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  167  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4395  anthranilate synthase component II  47.5 
 
 
200 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0932588  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.87 
 
 
187 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1219  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.73 
 
 
188 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.607602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  47.87 
 
 
187 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.21 
 
 
188 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  47.15 
 
 
192 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0052  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  43.92 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  45.41 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.15 
 
 
188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.708014  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  45.74 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3720  anthranilate synthase component II  46.63 
 
 
195 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  45.5 
 
 
197 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04000  anthranilate synthase component II  48.69 
 
 
189 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0158  anthranilate synthase component II  46.91 
 
 
194 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.965467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  45.21 
 
 
192 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  46.31 
 
 
201 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  46.28 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  47.15 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.43 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0018  anthranilate synthase, component II  46.32 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  45.83 
 
 
188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0180  anthranilate synthase component II  47.15 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.223965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  48.09 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>