19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3019 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  350  5e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  65.36 
 
 		 168 aa  191  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3216  hypothetical protein  58.99 
 
 		 143 aa  154  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3136  hypothetical protein  31.54 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00952291  hitchhiker  0.00000280076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  31.48 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0839  secreted periplasmic protein  32.12 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2497  secreted periplasmic protein  31.52 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2766  secreted periplasmic protein  30.99 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0044  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  32.32 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  29.56 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  33.54 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2049  secreted (periplasmic) protein-like protein  30.14 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  28.26 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  29.17 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  28.4 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  29.75 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  29.82 
 
 		 205 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>