64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2348 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.135989 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5689  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.08 
 
 		 181 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883457  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4733  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.97 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1345  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.91 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000291195  normal  0.059306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1846  glyoxalase family protein  47.66 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1306  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1625  hypothetical protein  47.66 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00462297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0803  glyoxalase family protein  44.53 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1893  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.6 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00822676  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34859  predicted protein  43.94 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0311877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.07 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.39 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.46 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0619  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.96 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  32.06 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4919  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.71 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  30.71 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.18 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3146  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451164  unclonable  0.00000000000414135 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0381  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.6 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0071702  normal  0.210559 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  29.07 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.43 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675157  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.44 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657624  decreased coverage  0.000000082582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1989  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000010528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  29.25 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  33.82 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  30.34 
 
 		 137 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 128 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.89 
 
 		 133 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  29.03 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0962  glyoxylase family protein  28.23 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.023462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  29.07 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  29.07 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  29.07 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  29.07 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  29.07 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  29.07 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  29.07 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  29.63 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.85 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000178969  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0908  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0680  methylmalonyl-CoA epimerase  29.92 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227621  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000152154  decreased coverage  0.00078643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3206  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000404623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  31.4 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  30.25 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>