16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1620 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  48.82 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.74 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  45.86 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  41.38 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.21 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  39.27 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  38.15 
 
 		 233 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  39.46 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  43.68 
 
 		 293 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.8 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  36.48 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  32.04 
 
 		 309 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  38.69 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  28.57 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  28.17 
 
 		 466 aa  41.6  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>