35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1584 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 98 aa  191  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  48.19 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  48.65 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  37.33 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  28 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  39.19 
 
 		 448 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 77 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 76 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  27.03 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>