More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3020 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3020  anthranilate synthase component II  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1428  anthranilate synthase component II  90.62 
 
 
211 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1663  anthranilate synthase component II  88.27 
 
 
200 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0146464  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2702  anthranilate synthase component II  88.72 
 
 
207 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2723  anthranilate synthase component II  88.27 
 
 
200 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2802  anthranilate synthase component II  88.27 
 
 
200 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1461  anthranilate synthase component II  91.58 
 
 
202 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1519  anthranilate synthase component II  91.09 
 
 
202 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0790647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2404  anthranilate synthase component II  88.54 
 
 
200 aa  353  6.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464228  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1527  anthranilate synthase component II  91.09 
 
 
202 aa  352  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452213  normal  0.0147223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2451  anthranilate synthase component II  84.9 
 
 
240 aa  338  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1589  anthranilate synthase component II  80.93 
 
 
204 aa  327  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1685  anthranilate synthase component II  78.61 
 
 
201 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2913  anthranilate synthase component II  80.1 
 
 
201 aa  316  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970253  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2130  anthranilate synthase component II  79.06 
 
 
199 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2252  anthranilate synthase component II  80 
 
 
202 aa  300  9e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3523  glutamine amido-transferase  56.99 
 
 
209 aa  231  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02759  anthranilate synthase component II  54.87 
 
 
202 aa  225  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003087  anthranilate synthase amidotransferase component  55.38 
 
 
202 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1933  anthranilate synthase component II  57.75 
 
 
192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.490866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2043  anthranilate synthase component II  57.75 
 
 
192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2830  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.73 
 
 
226 aa  220  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2668  anthranilate synthase component II  56.68 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2173  anthranilate synthase component II  56.68 
 
 
192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1153  anthranilate synthase component II  55.5 
 
 
202 aa  214  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1933  anthranilate synthase component II  56.15 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0795  anthranilate synthase component II  54.79 
 
 
203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  211  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  211  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  211  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  211  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  211  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  54.69 
 
 
531 aa  211  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  211  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  210  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.69 
 
 
531 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2305  anthranilate synthase component II  56.15 
 
 
192 aa  208  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2006  anthranilate synthase component II  56.15 
 
 
192 aa  207  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02289  glutamine amido-transferase  54.59 
 
 
210 aa  205  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1059  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50.26 
 
 
200 aa  195  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.37 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.46 
 
 
197 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  48.42 
 
 
188 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  48.42 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.42 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.94 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.67 
 
 
192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  47.34 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.7 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083636 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  48.19 
 
 
192 aa  171  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  46.63 
 
 
201 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.87 
 
 
188 aa  171  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.708014  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.81 
 
 
188 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  46.28 
 
 
204 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  47.37 
 
 
190 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2321  anthranilate synthase, component II  47.69 
 
 
195 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.81 
 
 
197 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  46.11 
 
 
201 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  46.81 
 
 
187 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  46.81 
 
 
187 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.34 
 
 
188 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  46.81 
 
 
187 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  46.81 
 
 
187 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  46.81 
 
 
187 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  44.62 
 
 
192 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4169  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  45.13 
 
 
204 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  167  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  47.37 
 
 
195 aa  167  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  167  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  46.28 
 
 
187 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  46.11 
 
 
197 aa  167  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4053  anthranilate synthase, component II  44.9 
 
 
204 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  42.13 
 
 
195 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  42.13 
 
 
195 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0158  anthranilate synthase component II  45.08 
 
 
194 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.965467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  44.62 
 
 
204 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  42.13 
 
 
195 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  43.15 
 
 
195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.63 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0897  anthranilate synthase component II  42.71 
 
 
192 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4187  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  43.62 
 
 
199 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  45.79 
 
 
197 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2495  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.11 
 
 
193 aa  165  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0786321  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0180  anthranilate synthase component II  45.08 
 
 
194 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.223965  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2861  anthranilate synthase component II  47.34 
 
 
195 aa  165  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
544 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>