More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1951 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1951  IS200 family transposase  100 
 
 		 82 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  97.56 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  97.56 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  93.83 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  92.59 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  92.59 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  92.59 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  88.41 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  88.41 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  88.41 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  88.41 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  88.41 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  88.41 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  86.96 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  60.49 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  60.49 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  60.49 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  60.49 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  60.49 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  60.49 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  60.49 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  60.49 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  60.49 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  59.26 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  65.06 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  65.06 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  65.06 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  65.06 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  65.06 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  65.06 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  65.06 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  63.86 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  51.39 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  51.39 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  51.39 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  51.43 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  51.43 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  49.37 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  51.43 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  51.43 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  51.43 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  51.43 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  51.43 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  51.43 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  51.43 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  50 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  47.89 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  46.25 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  48.57 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  46.84 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  46.84 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  46.84 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  46.25 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  48.1 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  46.84 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2878  insertion sequence transposase  46.84 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1610  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3127  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.53689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0340  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2332  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000426065  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1020  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2877  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1836  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2528  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0285  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2168  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.0653376 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1279  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000981056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1609  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0741274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1439  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.413019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0793  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365288  normal  0.44998 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1967  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1487  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.242166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  45 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1768  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000130923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1357  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0501528  decreased coverage  0.000176837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0103  IS1541 transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  46.84 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>