30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1148 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  780    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  86.21 
 
 		 377 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  84.88 
 
 		 377 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  85.68 
 
 		 377 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  73.95 
 
 		 408 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  74.93 
 
 		 403 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  75.14 
 
 		 398 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  72.8 
 
 		 402 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  72.87 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.26 
 
 		 379 aa  359  4e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.16 
 
 		 355 aa  352  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.15 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  48.39 
 
 		 381 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.55 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.11 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.28 
 
 		 410 aa  315  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.24 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  42.59 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  40.82 
 
 		 338 aa  266  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  38.02 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  37.61 
 
 		 317 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.32 
 
 		 333 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 		 346 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.45 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.59 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.16 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.25 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.44 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>