20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0390.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  338  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  40.29 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  41.18 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  31.13 
 
 		 151 aa  87.8  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  33.12 
 
 		 311 aa  87  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  31.33 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  31.08 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  35 
 
 		 360 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  28.49 
 
 		 198 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  29.53 
 
 		 194 aa  67.4  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  28.77 
 
 		 274 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  27.13 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  27.37 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  25.93 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  25.56 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  32.22 
 
 		 361 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  23.53 
 
 		 222 aa  44.3  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  34.88 
 
 		 202 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  25.29 
 
 		 220 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>