18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0384 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  32.74 
 
 		 274 aa  85.9  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  31.33 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  27.16 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  35.71 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  32.58 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  25.14 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  28.38 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  26.67 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  25.91 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  26.11 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  27.88 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  30.61 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  29.59 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  24.76 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  24.39 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  26.92 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>