39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2311 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2311  acetyltransferase  100 
 
 
172 aa  362  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2763  hypothetical protein  42.07 
 
 
165 aa  147  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2706  hypothetical protein  42.07 
 
 
165 aa  147  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  27.7 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.45 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  27.7 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  26.14 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  26.14 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  26.14 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.49 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29330  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.48 
 
 
174 aa  57.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2860  acetyltransferase, GNAT family  25.52 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  22.46 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.410828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  23.9 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0963  acetyltransferase  22.15 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.17018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  25.48 
 
 
169 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
170 aa  47.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.630016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1743  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
167 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  24.83 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  23.81 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  23.57 
 
 
175 aa  44.7  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4593  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.722115  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  26.96 
 
 
170 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0754  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3519  acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein  26.67 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.420967  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  21.19 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  23 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1259  GCN5-related N-acetyltransferase  22.7 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2234  GCN5-related N-acetyltransferase  22.98 
 
 
183 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000113859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0445  hypothetical protein  22.92 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  22.58 
 
 
168 aa  41.2  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>