14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0367 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0367  putative lipoprotein  100 
 
 
145 aa  289  9e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0732  hypothetical protein  76.19 
 
 
146 aa  220  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0748  hypothetical protein  76.19 
 
 
146 aa  220  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.5991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2014  Electron transfer DM13  28.67 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  39.51 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  30.48 
 
 
334 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  31.63 
 
 
227 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  30.61 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  24.39 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4975  hypothetical protein  33.64 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3316  Electron transfer DM13  27.38 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.83711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3238  hypothetical protein  26.09 
 
 
198 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  25.5 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  26.79 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.390859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>