36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2373 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  100 
 
 		 378 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  51.14 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  46.48 
 
 		 371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  39.38 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  37.71 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  36.31 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  36.16 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  36.98 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  35.85 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  33.51 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  36.16 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  35.2 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  33.7 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  33.05 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  37.46 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  34.24 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  30.05 
 
 		 443 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  31.67 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  29.97 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  36.48 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  31.48 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  30.79 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  34.73 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  30.53 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  30.53 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  29.2 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  30.14 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  40.62 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  30.62 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  27.76 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  27.78 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  25.5 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  27.69 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  30.72 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  28.98 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  33.33 
 
 		 644 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>