43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1187 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1187  methyltransferase type 11  100 
 
 
265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4465  methyltransferase type 11  57.98 
 
 
269 aa  298  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375613  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0817  methyltransferase type 11  58.5 
 
 
282 aa  287  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0755  Methyltransferase type 11  53.52 
 
 
270 aa  250  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  54.77 
 
 
266 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4407  methyltransferase type 11  53.57 
 
 
270 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2036  Methyltransferase type 11  55.65 
 
 
255 aa  241  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12641  methyltransferase  54.33 
 
 
273 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2049  methyltransferase type 11  53.94 
 
 
266 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1727  Methyltransferase type 11  45.97 
 
 
260 aa  236  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.312488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  32.81 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
248 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  29.3 
 
 
253 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  29.3 
 
 
253 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
235 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  24.44 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  29.24 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  23.56 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.1 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  23.76 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4394  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
192 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  29.12 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  24.31 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13866  hypothetical protein  36.11 
 
 
191 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  23.76 
 
 
239 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  23.33 
 
 
239 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.35 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  27.46 
 
 
355 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  23.7 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  43.24 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
207 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
207 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  23.63 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  23.63 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  23.76 
 
 
239 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
301 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  23.2 
 
 
239 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>