43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0665 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  294  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  51.41 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  50.71 
 
 
185 aa  117  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  52.78 
 
 
163 aa  116  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  44.22 
 
 
195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  44.22 
 
 
192 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  45.14 
 
 
216 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  47.48 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  46.76 
 
 
170 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  42.45 
 
 
175 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  42.45 
 
 
175 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  42.45 
 
 
175 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  46.76 
 
 
175 aa  103  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  42.36 
 
 
238 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  40.4 
 
 
175 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  45.32 
 
 
186 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  43.88 
 
 
321 aa  99.4  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  41.94 
 
 
179 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  43.88 
 
 
172 aa  97.1  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  43.14 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  40.79 
 
 
257 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  44.68 
 
 
194 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  39.07 
 
 
208 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  41.84 
 
 
328 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  40.85 
 
 
167 aa  92  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  43.75 
 
 
175 aa  91.3  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  38.13 
 
 
295 aa  90.9  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  38.73 
 
 
300 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  43.57 
 
 
226 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  32.61 
 
 
340 aa  87  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  44.6 
 
 
267 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  37.32 
 
 
162 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  44.29 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  38.03 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  38.03 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  36.17 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  38.06 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  34.42 
 
 
258 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30.63 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  32.77 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  27.06 
 
 
257 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  30.61 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  28.18 
 
 
201 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>